基层司法行政工作经过20多年的拼搏，越来越引起当地党委政府的重视，对基层司法所反响最多的是为他们解决了大量的矛盾纠纷，维护了社会的稳定。当前在机构改革、人员精简的情况下，将司法所列为十大办公室之一，这充分肯定了司法行政部门在镇级人民政府中的地位。但是，随着形势的发展与变化，司法所在运作过程中也存在着不少问题，主要有以下几个方面：
1、职能过于繁琐，人员偏少。过去司法办公室与法律服务所两
块牌子、一套人马，三四万人口的乡镇就有3—4人组成，主要担负着人民调解、法制宣传、律师业务和协办公证四方面的业务。法律服务所人员虽然是事业编制，但也承担着人民调解和法制宣传等大量司法行政工作业务，同时也为公民、法人、事业单位提供了大量的法律服务，因此司法行政的地位逐年提高。但是，随着室所分离、角色转换、职能转变等情况的改变，法律服务所的人员全部转出司法所，人员普遍减少。近年来随着形势的发展，镇的普遍合并，司法所的门口的牌子已从过去的两块增加到现在的八九块之多，并且还有增加的可能。目前要逐行落实这些牌子上的职能，仅靠2—3人是很难正常开展，只能应付面上的工作，与过去相比，形式上看似乎加强了力量，实质上削弱了力量。
2、工作存在需要协调多，可操作性难的问题。从司法所门口的
牌子看，大多是这“中心”，那“委员会”或“工作站”，这些领导小组的办公室且多设在司法所。开展这些工作，部分是司法行政的职能范围，但大多是其余部门的共同职责，司法所只是起到协调作用。这些看似司法所地位提高，实是给司法所的人员出了一道难题，司法所的工作感到务虚多，务实少。当然要做好这些工作，一要看司法所长的协调力度，二要看分管领导的重视程度。面对新的形势，社会矛盾出现新的变化，处理矛盾纠纷的方式也应有所改变。但要按照这些“中心”、“委员会”来开展工作，在司法所是很难开展的，难在可操作性。如何开拓创新工作机制，有时上级司法行政部门还缺少指导性意见，所以有时只能各镇各做，做了再说，缺少规范。
3、基层司法所人员变动过大，缺乏相对稳定。司法所人员变动
较大，工作缺少连续性，有体制上的问题，也有司法行政工作在基层开展难，留不住人的问题。目前基层司法所工作人员在岗不在编，在编不在岗的现象比较严重。进出人员由基层政府领导说了算，上级司法行政部门无权决定。另外特岗津贴等待遇享受标准不一，人为造成等级制，影响了工作人员的积极性。
4、参与其他工作过多，影响了司法行政工作抓指导抓落实。
司法所的工作人员除外出招商的领导没有指派工作外，其余个个领导都有要求参与其分管工作的情况，工作普遍过杂过乱，不但要征地拆迁、大环境整治、创建园区建设，还有载体建设工程量、农保、绿化质量等等，出现了杂而无序，杂而不精的“撒味精”的现象。
5、司法行政经费无保障。司法行政在开展法制宣传、表彰先进
典型等工作时都必须有一定的经济作保障。过去在司法办与法律服务所合署办公时，依托法律服务部分业务收费作为法制宣传等费用的支出。但目前每开展一次工作，凡涉及到经费支出的，每一份开支必须先申请，待领导批准后才能实施，年初没有计划的、没有预算的很难得到落实。上级又没有一分钱拨款，巧妇难为无米之炊。
加强司法所建设的建议和对策：
1、抓好业务指导。上级司法行政部门要切实加强对司法所工作
的调研，指导司法所开展工作要切实可行，有针对性和可操作性。要加强与镇领导的联系，了解司法所开展工作情况，争取当地党委政府的支持。
2、加强业务培训，提高司法所人员政治业务素质。可以采用集
中培训、业务交流、外出参观学习，提高工作能力，提高协调能力。
3、改变在岗不在编或在编不在岗的局面。上级司法行政部门应
协调解决在职人员的待遇问题，如特岗津贴，提高在职人员积极性。
4、把好人员出入关。要将业务知识较好又热爱司法行政工作的
同志充实到司法行政队伍来，对在岗人员定期进行全能考核，对不适应司法行政工作的同志做到能进能出。
5、尽可能提高现职人员待遇。司法所工作人员工作繁琐，经常
放弃节假日处理矛盾纠纷等工作，但在政法系统待遇仍然偏低。一定程度上影响了工作的积极性。